More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4238 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
337 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.01 
 
 
355 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 
336 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 
335 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.95 
 
 
339 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
336 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
336 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.43 
 
 
335 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.15 
 
 
337 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 
337 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.46 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 
337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
337 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 
337 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
338 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
338 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
338 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  60.18 
 
 
342 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.36 
 
 
347 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  54.08 
 
 
360 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 
336 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
348 aa  348  9e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
339 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
345 aa  339  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
327 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
336 aa  332  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
332 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
334 aa  329  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
328 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
336 aa  322  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
347 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
338 aa  321  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
350 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
334 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
365 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
339 aa  318  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
334 aa  318  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
350 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
328 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
334 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
355 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
334 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
332 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
346 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
346 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
334 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
334 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
347 aa  315  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
345 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
350 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
346 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
341 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
355 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
332 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
355 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
332 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
332 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
349 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
330 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
332 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
332 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
332 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
334 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
333 aa  309  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
347 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
355 aa  308  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
357 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
357 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
332 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>