More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5824 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1052 aa  2081    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 
1019 aa  327  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.72 
 
 
715 aa  278  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 
707 aa  278  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.05 
 
 
785 aa  274  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.81 
 
 
763 aa  273  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.24 
 
 
795 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  31.17 
 
 
762 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.46 
 
 
729 aa  271  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.34 
 
 
741 aa  271  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  29.37 
 
 
714 aa  270  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.74 
 
 
755 aa  269  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 
724 aa  266  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.26 
 
 
742 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.72 
 
 
739 aa  266  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.69 
 
 
794 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 
1016 aa  262  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 
751 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 
666 aa  262  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 
751 aa  262  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.33 
 
 
858 aa  262  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 
747 aa  261  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  28.46 
 
 
753 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 
747 aa  261  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  32.11 
 
 
744 aa  261  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 
751 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  28.46 
 
 
751 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.31 
 
 
753 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.16 
 
 
741 aa  260  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.16 
 
 
753 aa  260  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.97 
 
 
838 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.53 
 
 
851 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.31 
 
 
896 aa  259  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.75 
 
 
858 aa  258  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.32 
 
 
786 aa  257  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.56 
 
 
829 aa  257  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.74 
 
 
747 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.75 
 
 
737 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 
736 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.15 
 
 
768 aa  254  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.65 
 
 
857 aa  254  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 
738 aa  254  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 
746 aa  253  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 
738 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.47 
 
 
773 aa  253  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.1 
 
 
1023 aa  251  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  29.32 
 
 
900 aa  251  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.15 
 
 
754 aa  251  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.31 
 
 
738 aa  251  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  32.74 
 
 
797 aa  251  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.6 
 
 
706 aa  251  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.3 
 
 
694 aa  250  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  30.18 
 
 
787 aa  250  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.06 
 
 
781 aa  250  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  32.44 
 
 
797 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.16 
 
 
768 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.56 
 
 
762 aa  249  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.64 
 
 
797 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 
807 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.78 
 
 
718 aa  247  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.78 
 
 
730 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 
732 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.32 
 
 
833 aa  246  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 
731 aa  245  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.8 
 
 
711 aa  244  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  26.66 
 
 
726 aa  244  7.999999999999999e-63  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.29 
 
 
806 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.06 
 
 
797 aa  243  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 
779 aa  241  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.84 
 
 
671 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  27.49 
 
 
765 aa  240  8e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.75 
 
 
772 aa  240  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 
764 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 
730 aa  239  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 
730 aa  239  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  30.53 
 
 
771 aa  239  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.65 
 
 
658 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  32.6 
 
 
671 aa  237  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  32.6 
 
 
671 aa  237  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.35 
 
 
751 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 
731 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 
735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  27.67 
 
 
769 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.5 
 
 
751 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.38 
 
 
837 aa  236  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 
672 aa  235  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 
662 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 
659 aa  235  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 
790 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  28.64 
 
 
723 aa  235  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.61 
 
 
783 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.49 
 
 
662 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 
762 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  28.06 
 
 
721 aa  234  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 
668 aa  234  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  30.03 
 
 
742 aa  234  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.26 
 
 
765 aa  234  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 
783 aa  234  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  32.58 
 
 
779 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  30.64 
 
 
688 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>