More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4121 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  100 
 
 
328 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  52.76 
 
 
327 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  57.93 
 
 
324 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  48.84 
 
 
340 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  50.82 
 
 
335 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  42.21 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  44.15 
 
 
327 aa  212  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  44.88 
 
 
316 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
331 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
342 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.81 
 
 
342 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.81 
 
 
334 aa  205  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
334 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
334 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 
309 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 
306 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.69 
 
 
334 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  44.55 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 
312 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 
324 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.02 
 
 
330 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.02 
 
 
330 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.02 
 
 
330 aa  198  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  39.8 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  41.5 
 
 
345 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.4 
 
 
323 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 
311 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
311 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
311 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.82 
 
 
334 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  39.61 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.94 
 
 
311 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.61 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.61 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.61 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.61 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.2 
 
 
333 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
309 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  44.78 
 
 
336 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.75 
 
 
322 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
346 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  40.2 
 
 
327 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  40.96 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  40.13 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  37 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.2 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  38.36 
 
 
345 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  38.36 
 
 
345 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  38.36 
 
 
345 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  37.83 
 
 
331 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.74 
 
 
336 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  38.41 
 
 
324 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  36.39 
 
 
329 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
338 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
314 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  38.82 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  38.36 
 
 
341 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  43.21 
 
 
348 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
328 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  35.28 
 
 
335 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.5 
 
 
327 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  35.19 
 
 
335 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  36.62 
 
 
342 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  37.95 
 
 
337 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
345 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
343 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.74 
 
 
322 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
345 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
343 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.14 
 
 
322 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  38.04 
 
 
335 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  40.52 
 
 
318 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  40.21 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.24 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  39.58 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.74 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.03 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 
347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.92 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 
345 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 
314 aa  173  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  36.42 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  35.15 
 
 
335 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  38.67 
 
 
315 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  38.7 
 
 
363 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.6 
 
 
358 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.66 
 
 
310 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  33.65 
 
 
338 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.66 
 
 
310 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  36.13 
 
 
334 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>