70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2623 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 382 aa  776    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  43.34 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  26.28 
 
 		 833 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  28.83 
 
 		 718 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.77 
 
 		 487 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  25.64 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  27.71 
 
 		 952 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.62 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  26.89 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  28.66 
 
 		 913 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  27.33 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  26.18 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  29.78 
 
 		 929 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  27.46 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 1118 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  25.16 
 
 		 644 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  26.6 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  26.13 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  26.71 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  26.46 
 
 		 625 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  38.6 
 
 		 877 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  26.46 
 
 		 625 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  40.3 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  25.76 
 
 		 603 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  27.47 
 
 		 986 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  42.05 
 
 		 540 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 563 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  43.02 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  24.45 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  32.3 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  34.29 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  35.24 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  25.82 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.85 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  35.34 
 
 		 1327 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  24.76 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  48.39 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  30.91 
 
 		 646 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.24 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  27.91 
 
 		 747 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  29.01 
 
 		 203 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  25.3 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  40.62 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  35.65 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  35.65 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  39.39 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  29.94 
 
 		 1426 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  46.15 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  25.15 
 
 		 1174 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  40.7 
 
 		 756 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  25 
 
 		 583 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  29.06 
 
 		 686 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  24.78 
 
 		 1164 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  21.6 
 
 		 660 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  46.77 
 
 		 1138 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  36.05 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  39.68 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  39.51 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  37.21 
 
 		 296 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  23.5 
 
 		 561 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  29.89 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  22.02 
 
 		 642 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  37.33 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  39.13 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>