More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0695 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  56.84 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  58.27 
 
 		 288 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  56.16 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  53.45 
 
 		 285 aa  315  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  51.09 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  51.09 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  52.35 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  50.72 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  52.9 
 
 		 288 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  50.72 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  51.26 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  51.81 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  45.99 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  48.03 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  48.03 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  47.25 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  47.48 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  47.99 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  45.39 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  45 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  44.68 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  43.97 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  42.45 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  43.62 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  43.66 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  42.96 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  42.35 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  41.22 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  41.67 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  38.85 
 
 		 304 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  41.37 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  41.3 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  38.99 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  38.63 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  38.49 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  37.99 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  36.75 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  40 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.57 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  38.25 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  38.49 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  34.49 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  34.15 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  36.46 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  33.81 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  33.81 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  33.81 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  34.49 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  33.9 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  37.09 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  35 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  37.36 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  35.13 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  35.13 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  35.13 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  32.2 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  36.17 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  31.65 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  33.45 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  38.01 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  31.97 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  32.97 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  34.53 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  35.38 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  36.67 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  33.56 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  34.8 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  34.64 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  32.74 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  37.46 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  31.4 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  31.4 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  32.01 
 
 		 320 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  32.01 
 
 		 320 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  31.86 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  35.87 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.28 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  32.17 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  33.56 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  30.48 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  35.9 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  32.73 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  31.16 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  32.97 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  31.29 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  31.79 
 
 		 327 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  32.51 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  33.22 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  32.66 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  30.94 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3104  agmatinase  35.82 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  30.62 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>