More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6236 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  100 
 
 		 314 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  68.08 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  67.21 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  66.78 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  66.34 
 
 		 320 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  64.82 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  61.31 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  60.46 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  63.11 
 
 		 315 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  62.42 
 
 		 313 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  59.03 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.93 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.93 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  55.02 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  55.02 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.81 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  54.66 
 
 		 460 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  54.07 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.67 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.23 
 
 		 311 aa  348  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 313 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  55.13 
 
 		 458 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  55.31 
 
 		 456 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  54.93 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  52.13 
 
 		 321 aa  341  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  56.59 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  52.19 
 
 		 361 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 311 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  52.88 
 
 		 314 aa  339  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  51.28 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  51.28 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.63 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  51.47 
 
 		 321 aa  338  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 314 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  51.32 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.83 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 453 aa  334  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  51.94 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  51.97 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  51.48 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 319 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 321 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  50.8 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 324 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  51.25 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  53.33 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  50 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  51.63 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2208  thioredoxin reductase  52.56 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 311 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 461 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 461 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  51.15 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  51.77 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  51.77 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  51.77 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  49.03 
 
 		 348 aa  322  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  51.76 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  52.55 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  50.79 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  52.87 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  51.49 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  49.03 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  51.92 
 
 		 315 aa  322  6e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 321 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  51.82 
 
 		 321 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  51.08 
 
 		 371 aa  320  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  49.21 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  51.92 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  51.11 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  51.13 
 
 		 547 aa  319  5e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 316 aa  318  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 314 aa  318  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  51.61 
 
 		 316 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 		 333 aa  318  9e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  51.27 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 322 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>