More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3647 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 442 aa  875    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.84 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  44.27 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  45.29 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.5 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  41.91 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.67 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.72 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 441 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.3 
 
 		 463 aa  348  8e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  41.38 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  42.47 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.47 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 		 447 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  42.63 
 
 		 445 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  41.01 
 
 		 432 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.2 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  43.89 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  42.11 
 
 		 438 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  43.67 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  40.75 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.67 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40.4 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  41.47 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.37 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  39.37 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  40.65 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  41.19 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  41.76 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  39.96 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  40.4 
 
 		 437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 443 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 443 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  40.35 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  40.22 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  42.76 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  39.33 
 
 		 443 aa  335  9e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.48 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.87 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  42.53 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  39.52 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  41.74 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  42.24 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  42.24 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  41.79 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  40.04 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.07 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.08 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  40.7 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  40.58 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.48 
 
 		 437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.31 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  39.92 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.1 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.38 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  43.14 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 443 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  39.25 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  40.49 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  40.22 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  39.16 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  38.28 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  42.48 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  39.61 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  41.7 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  39.29 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  42.48 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>