More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2702 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  100 
 
 
401 aa  815    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  48.55 
 
 
402 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  46.28 
 
 
406 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  47.68 
 
 
378 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  45.28 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  44.77 
 
 
393 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  44.42 
 
 
375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.39 
 
 
422 aa  298  9e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.03 
 
 
417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.81 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.89 
 
 
375 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  38.54 
 
 
381 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  36.27 
 
 
572 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  35.25 
 
 
411 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.85 
 
 
357 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.23 
 
 
372 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.31 
 
 
370 aa  203  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  42.2 
 
 
360 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  41.56 
 
 
395 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40.17 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.28 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  41.79 
 
 
546 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.09 
 
 
331 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.74 
 
 
346 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  41.29 
 
 
545 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  40.7 
 
 
546 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  40.7 
 
 
546 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  40.7 
 
 
546 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  40.7 
 
 
546 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  40.7 
 
 
546 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  38.64 
 
 
548 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  40.3 
 
 
554 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  40 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  40 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  27.7 
 
 
393 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 
375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  46.36 
 
 
135 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  64.47 
 
 
359 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  59.21 
 
 
97 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  57.89 
 
 
97 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  57.89 
 
 
97 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  54.26 
 
 
153 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 
150 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 
150 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  55.06 
 
 
154 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  53.93 
 
 
154 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  55.06 
 
 
151 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  62.67 
 
 
113 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  53.93 
 
 
154 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  51 
 
 
155 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  49.45 
 
 
226 aa  99.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  54.44 
 
 
143 aa  99.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
143 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  60.81 
 
 
139 aa  99.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
124 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
165 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
162 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  54.44 
 
 
142 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
165 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
162 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  62.16 
 
 
162 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  60.81 
 
 
156 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  51.14 
 
 
149 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  60.27 
 
 
190 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  51.14 
 
 
149 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  54.44 
 
 
159 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  51.69 
 
 
163 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  53.68 
 
 
142 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 
162 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  51.69 
 
 
162 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 
161 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 
162 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 
163 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  60.27 
 
 
170 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  60.27 
 
 
180 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  57.33 
 
 
174 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  48.94 
 
 
249 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  51.69 
 
 
132 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  56 
 
 
188 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  45.79 
 
 
246 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  52.5 
 
 
137 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  52.38 
 
 
147 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  44.94 
 
 
175 aa  96.7  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 
137 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  40.16 
 
 
135 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 
137 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 
137 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 
137 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 
137 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 
137 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  51.25 
 
 
137 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  54.02 
 
 
111 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  51.19 
 
 
152 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 
137 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  58.9 
 
 
175 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  53.85 
 
 
157 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  51.76 
 
 
136 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  45.1 
 
 
137 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  56.76 
 
 
143 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  53.85 
 
 
157 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>