More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0822 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  100 
 
 
396 aa  818    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  43.72 
 
 
221 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 
217 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  44.98 
 
 
226 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  44.86 
 
 
216 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  40.87 
 
 
214 aa  155  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  40.95 
 
 
220 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.27 
 
 
210 aa  134  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  35.27 
 
 
221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  38.86 
 
 
195 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  35.75 
 
 
456 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  35.75 
 
 
456 aa  122  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
456 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 
232 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 
229 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  36.02 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.32 
 
 
224 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
232 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.11 
 
 
202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  35.47 
 
 
215 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.42 
 
 
218 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  35.48 
 
 
222 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  35.48 
 
 
222 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  36.07 
 
 
212 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
173 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  33.82 
 
 
229 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
236 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  33.18 
 
 
246 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  37.3 
 
 
223 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  35.52 
 
 
212 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.57 
 
 
219 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.83 
 
 
227 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  31.67 
 
 
214 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
221 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.96 
 
 
218 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.98 
 
 
216 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.19 
 
 
223 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.03 
 
 
219 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.82 
 
 
220 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 
225 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.02 
 
 
219 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.33 
 
 
214 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
227 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  34.97 
 
 
221 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 
235 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.65 
 
 
227 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.98 
 
 
223 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  36.76 
 
 
223 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
223 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  32.47 
 
 
209 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  33.66 
 
 
230 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.98 
 
 
216 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
222 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.36 
 
 
221 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.28 
 
 
235 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 
220 aa  99.8  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
216 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  34.78 
 
 
223 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.94 
 
 
221 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
216 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.66 
 
 
233 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.94 
 
 
221 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  33.88 
 
 
224 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
242 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.07 
 
 
228 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  30.99 
 
 
222 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 
222 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  30.99 
 
 
222 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  32.42 
 
 
212 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.99 
 
 
222 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.99 
 
 
222 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 
214 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  29.56 
 
 
227 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 
233 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
229 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.22 
 
 
188 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.22 
 
 
188 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.35 
 
 
217 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.71 
 
 
202 aa  97.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.59 
 
 
222 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.59 
 
 
222 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.59 
 
 
222 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.22 
 
 
188 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.59 
 
 
222 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  30.13 
 
 
230 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 
226 aa  96.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.67 
 
 
188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.26 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.59 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.11 
 
 
231 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.26 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.67 
 
 
188 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.26 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.91 
 
 
217 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.26 
 
 
222 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>