199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0029 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  42.68 
 
 
251 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  42.28 
 
 
251 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  42.28 
 
 
251 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  41.46 
 
 
251 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  42.28 
 
 
251 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  41.46 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  42.28 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  41.87 
 
 
251 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1864  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  40.4 
 
 
153 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.804482  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  30.7 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  25.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1863  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  41.25 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  26.19 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  25.54 
 
 
292 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.13 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  24.6 
 
 
283 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  24.6 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  26.5 
 
 
276 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  24.09 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  24.6 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  24.6 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  24.6 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  24.6 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  24.6 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.13 
 
 
265 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  26.17 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  25.36 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  22.37 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  25.36 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  25.93 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.27 
 
 
316 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  22.07 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  25.93 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  30.14 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  25.93 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  24.7 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  25.46 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  25.46 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  25.93 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.44 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  21.8 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  20.55 
 
 
293 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  23.61 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  24.87 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  21.52 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.19 
 
 
282 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.44 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  23.91 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
283 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  24.87 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  25.85 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.5 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  25.12 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.38 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  25.37 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.91 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.35 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 
223 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.85 
 
 
235 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  29.92 
 
 
249 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  24.02 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
634 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  24.82 
 
 
259 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.85 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  24.19 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  21.5 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>