More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2231 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 203 aa  423  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  86.07 
 
 		 203 aa  374  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  83.17 
 
 		 203 aa  367  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  80.2 
 
 		 203 aa  361  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.73 
 
 		 203 aa  347  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  77.72 
 
 		 203 aa  347  9e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  77.23 
 
 		 203 aa  345  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.12 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.68 
 
 		 277 aa  167  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.5 
 
 		 284 aa  162  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.71 
 
 		 298 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.27 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.27 
 
 		 284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  40.43 
 
 		 291 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.43 
 
 		 291 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.62 
 
 		 286 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.96 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.1 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  40.43 
 
 		 312 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.88 
 
 		 309 aa  144  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.11 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.74 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.7 
 
 		 300 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.9 
 
 		 306 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.38 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.21 
 
 		 281 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.74 
 
 		 281 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.34 
 
 		 329 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.18 
 
 		 296 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.97 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.2 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.44 
 
 		 281 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.31 
 
 		 344 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.82 
 
 		 288 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  40.93 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.24 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.39 
 
 		 290 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.06 
 
 		 294 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.54 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.36 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.86 
 
 		 154 aa  121  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  44.62 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.44 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.07 
 
 		 142 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  43.07 
 
 		 144 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.14 
 
 		 291 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  46.4 
 
 		 132 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  46.46 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  45.67 
 
 		 133 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.8 
 
 		 133 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.24 
 
 		 133 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.15 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.24 
 
 		 133 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.86 
 
 		 149 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.28 
 
 		 132 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.28 
 
 		 132 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  46.46 
 
 		 122 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  44.09 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.8 
 
 		 131 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  44.44 
 
 		 128 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.6 
 
 		 127 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.88 
 
 		 139 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  43.41 
 
 		 143 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  42.42 
 
 		 133 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.41 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  43.31 
 
 		 138 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.44 
 
 		 128 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  46.03 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  46.03 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  46.03 
 
 		 133 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  41.09 
 
 		 144 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.38 
 
 		 134 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.28 
 
 		 135 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.24 
 
 		 142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  44.53 
 
 		 128 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  44 
 
 		 150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  44 
 
 		 128 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  42.97 
 
 		 129 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.45 
 
 		 133 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  41.91 
 
 		 138 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.8 
 
 		 128 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  43.65 
 
 		 137 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.31 
 
 		 135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  43.2 
 
 		 133 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  42.4 
 
 		 123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  44 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.86 
 
 		 146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.2 
 
 		 124 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  42.31 
 
 		 133 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  41.91 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  43.65 
 
 		 127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  43.65 
 
 		 125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  43.75 
 
 		 128 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.19 
 
 		 137 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  41.79 
 
 		 153 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 129 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  44 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>