More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2407 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  244  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  83.19 
 
 		 119 aa  207  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  81.51 
 
 		 119 aa  200  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  78.15 
 
 		 119 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  73.11 
 
 		 119 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  72.27 
 
 		 119 aa  183  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  52.94 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  57.66 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  54.81 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  56.6 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  47.93 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  47.93 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  47.93 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  53.21 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  47.11 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  54.9 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  50.88 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  48.7 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  51.72 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  49.04 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  55.56 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  54.9 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  54.72 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  48.72 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  49.07 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  50.96 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  49.09 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  46.43 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  52.83 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  54.08 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  45.76 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  50.42 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  55.88 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  45 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  51.35 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  47.11 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  51 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  51.61 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  47.54 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  49.53 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>