37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0004 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  196  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  48.45 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  47.42 
 
 
97 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  48.39 
 
 
102 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  42.27 
 
 
97 aa  100  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  41.94 
 
 
96 aa  93.2  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  38.14 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  34.07 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  29.35 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30.21 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.67 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  29.17 
 
 
162 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  29.67 
 
 
152 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  28.89 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  27.47 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  35.94 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  27.59 
 
 
96 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  26.37 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  30.68 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  26.6 
 
 
287 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  31.87 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  34.29 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  25.56 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  24.18 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  24.18 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  24.18 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  30.67 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  26.14 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 
172 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  35.48 
 
 
101 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  33.93 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  34.78 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  34.43 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  32.39 
 
 
156 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  33.87 
 
 
101 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>