More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2070 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  44.88 
 
 		 765 aa  653    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  51.09 
 
 		 764 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  71.65 
 
 		 773 aa  1165    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  49.87 
 
 		 755 aa  734    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  48.34 
 
 		 783 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  52.8 
 
 		 769 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  71.41 
 
 		 778 aa  1166    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  52.18 
 
 		 749 aa  775    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 789 aa  1619    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  43.76 
 
 		 768 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  53.71 
 
 		 757 aa  779    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.04 
 
 		 729 aa  569  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  39.21 
 
 		 741 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.37 
 
 		 755 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.4 
 
 		 751 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.4 
 
 		 751 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.22 
 
 		 759 aa  555  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  40.28 
 
 		 743 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.48 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.87 
 
 		 754 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.49 
 
 		 741 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  38.75 
 
 		 735 aa  547  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  40.82 
 
 		 735 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 		 743 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.32 
 
 		 725 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.44 
 
 		 747 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.59 
 
 		 747 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  39.48 
 
 		 739 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.49 
 
 		 753 aa  532  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  39.23 
 
 		 736 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  40.05 
 
 		 757 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  40.83 
 
 		 770 aa  532  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.77 
 
 		 757 aa  531  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.51 
 
 		 734 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.69 
 
 		 785 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.69 
 
 		 766 aa  528  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.03 
 
 		 715 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.58 
 
 		 751 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  43.58 
 
 		 753 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  43.58 
 
 		 751 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.05 
 
 		 737 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.58 
 
 		 747 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  39.69 
 
 		 744 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.58 
 
 		 751 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.29 
 
 		 753 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.58 
 
 		 751 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.25 
 
 		 772 aa  518  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  43.61 
 
 		 678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  38.29 
 
 		 762 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  39.23 
 
 		 739 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  38.35 
 
 		 724 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.61 
 
 		 781 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  37.81 
 
 		 721 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.57 
 
 		 729 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.23 
 
 		 741 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.8 
 
 		 833 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.66 
 
 		 786 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.53 
 
 		 748 aa  508  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.61 
 
 		 730 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  39.19 
 
 		 737 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.53 
 
 		 795 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  40.63 
 
 		 807 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.25 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.91 
 
 		 765 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.74 
 
 		 758 aa  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.07 
 
 		 857 aa  505  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.54 
 
 		 829 aa  502  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.14 
 
 		 831 aa  501  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.38 
 
 		 742 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  40.49 
 
 		 724 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.14 
 
 		 756 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.67 
 
 		 806 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.59 
 
 		 858 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.85 
 
 		 711 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  37.55 
 
 		 762 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.24 
 
 		 851 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  38.76 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  40.15 
 
 		 735 aa  497  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  39.02 
 
 		 714 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.53 
 
 		 794 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.01 
 
 		 730 aa  499  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.01 
 
 		 730 aa  499  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  42.92 
 
 		 678 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  38.25 
 
 		 723 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  37.36 
 
 		 726 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.9 
 
 		 773 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  37.67 
 
 		 741 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  43.12 
 
 		 731 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 812 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.42 
 
 		 837 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  36.56 
 
 		 722 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.17 
 
 		 858 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.25 
 
 		 739 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  38 
 
 		 787 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  37.02 
 
 		 721 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.18 
 
 		 817 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.49 
 
 		 768 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.81 
 
 		 788 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  37.82 
 
 		 728 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  36.43 
 
 		 722 aa  489  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>