More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1788 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  81.49 
 
 		 442 aa  696    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  81.11 
 
 		 450 aa  716    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  100 
 
 		 442 aa  893    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  68.2 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.13 
 
 		 443 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  69.11 
 
 		 445 aa  601  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  66.06 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  65.61 
 
 		 439 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  62.68 
 
 		 440 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  59.82 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  59.68 
 
 		 450 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  58.12 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  57.98 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.11 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  54.19 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.94 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  53.29 
 
 		 455 aa  485  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  53.02 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  53.02 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.34 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.67 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  56.24 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  56.46 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  55.25 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.91 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.49 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  54.34 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  53.14 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  53.29 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.48 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  53.88 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.74 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.2 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  53.79 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  54.76 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  52.86 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  52.03 
 
 		 492 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  52.58 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.58 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.95 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.12 
 
 		 511 aa  463  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  52.46 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.2 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  54.31 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  52 
 
 		 455 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 456 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  51.93 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  52.24 
 
 		 515 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  52.51 
 
 		 455 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.79 
 
 		 507 aa  458  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.73 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  51.69 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  51.11 
 
 		 455 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  52 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  52.57 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 455 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  51.56 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  50.9 
 
 		 556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  51.57 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  53.48 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.89 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3094  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.76 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  51.58 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  53.69 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  52.02 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  52.02 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.03 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2811  putative signal recognition particle protein  51.85 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.626548  normal  0.183839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  53.02 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.22 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  53.02 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  49.88 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.52 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>