More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1537 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
399 aa  817    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  40.92 
 
 
417 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  38.74 
 
 
418 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  35.85 
 
 
432 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 
442 aa  245  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
431 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 
431 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  29.31 
 
 
427 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
443 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  32.46 
 
 
436 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  32.44 
 
 
450 aa  207  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
413 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 
437 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  30.27 
 
 
446 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  30.41 
 
 
446 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 
411 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.49 
 
 
452 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 
447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  30.32 
 
 
439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  34.55 
 
 
388 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  33.03 
 
 
472 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  33.17 
 
 
401 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  30.32 
 
 
419 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  31.89 
 
 
407 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  30.28 
 
 
453 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.64 
 
 
478 aa  186  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  30.41 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
427 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 
443 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  30.41 
 
 
470 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  30.43 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  29.28 
 
 
474 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.38 
 
 
488 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.62 
 
 
446 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  30.58 
 
 
458 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  30.18 
 
 
440 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  29.83 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  30.61 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  29.44 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  31.12 
 
 
453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  29.27 
 
 
446 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  29.84 
 
 
448 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  29.66 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.54 
 
 
471 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  29.37 
 
 
455 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  30.28 
 
 
468 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  29.09 
 
 
482 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  30.45 
 
 
459 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  28.98 
 
 
443 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  29.79 
 
 
436 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  29.75 
 
 
453 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  31.54 
 
 
443 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  29.39 
 
 
474 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  30.21 
 
 
447 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  31.18 
 
 
435 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  29.89 
 
 
444 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  27.59 
 
 
452 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  28.63 
 
 
494 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  28.85 
 
 
472 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  28.63 
 
 
478 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  28.1 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  28.05 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  30.05 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  29.11 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  30.07 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  28.81 
 
 
443 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  30.54 
 
 
475 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  29.84 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  28.47 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  28.38 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  27.42 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  30.05 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  29.22 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  29.71 
 
 
440 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  30.25 
 
 
444 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  29.67 
 
 
476 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  30.75 
 
 
475 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  29.27 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  29.06 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  29.16 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  28.64 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  30.72 
 
 
439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  27.29 
 
 
451 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  27.73 
 
 
451 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  29.7 
 
 
470 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  28.44 
 
 
458 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  27.49 
 
 
451 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  27.95 
 
 
452 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  27.86 
 
 
458 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  29.36 
 
 
466 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  29.34 
 
 
470 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  29.34 
 
 
470 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  27.49 
 
 
451 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  27.31 
 
 
472 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  28.3 
 
 
491 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  30.62 
 
 
474 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.33 
 
 
475 aa  160  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>