134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0816 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 
445 aa  881    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  38.79 
 
 
459 aa  266  4e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  42.82 
 
 
448 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  42.67 
 
 
446 aa  253  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  41.48 
 
 
428 aa  250  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  41.93 
 
 
440 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  37.72 
 
 
443 aa  249  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  39.48 
 
 
422 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  40.84 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  38.59 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  39.27 
 
 
442 aa  246  6e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  42.93 
 
 
440 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  42.11 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  42.93 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  41.33 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  41.41 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  35.02 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  41.06 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  42.54 
 
 
435 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  41.53 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  40.39 
 
 
420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  43.14 
 
 
439 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  43.7 
 
 
439 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  41.71 
 
 
443 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  43.14 
 
 
439 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  39.43 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  41.9 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  36.99 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  39.95 
 
 
429 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  39.5 
 
 
421 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  35.55 
 
 
417 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  35.55 
 
 
417 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  39.59 
 
 
420 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  41.09 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  39.54 
 
 
421 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  37.97 
 
 
424 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  37.89 
 
 
423 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  40.86 
 
 
453 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  35.21 
 
 
421 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  41.41 
 
 
421 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  37.78 
 
 
452 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  38.4 
 
 
424 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  40.8 
 
 
424 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  40.52 
 
 
424 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  40.23 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  33.26 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  37.12 
 
 
428 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  36.55 
 
 
421 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  37.12 
 
 
448 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  40.54 
 
 
411 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  41.6 
 
 
447 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  37.67 
 
 
458 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  40.89 
 
 
419 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  41.12 
 
 
435 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  38.89 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  37.14 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  38.05 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  35 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  39.01 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  42.32 
 
 
421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  34.64 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  40.34 
 
 
422 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  41.55 
 
 
440 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  37.05 
 
 
424 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1724  MOFRL domain protein  36 
 
 
400 aa  210  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  32.25 
 
 
403 aa  209  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  37.75 
 
 
450 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  40.63 
 
 
413 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  38.44 
 
 
446 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  39.1 
 
 
422 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  37.74 
 
 
496 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  39.63 
 
 
374 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  38.68 
 
 
434 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  37.16 
 
 
437 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  40.17 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  42.03 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  37.16 
 
 
437 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  36.83 
 
 
432 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  37.23 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  39.13 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  35.33 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  33.57 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  35.14 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  35.2 
 
 
439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  35.42 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  32.71 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  37.26 
 
 
437 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  34.07 
 
 
454 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2013  hydroxypyruvate reductase  35.53 
 
 
395 aa  196  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  35.7 
 
 
404 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  38.46 
 
 
428 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  38.53 
 
 
439 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  36.85 
 
 
432 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  35.19 
 
 
504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  31.94 
 
 
409 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  35.6 
 
 
437 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  36.32 
 
 
428 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  40.17 
 
 
438 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  37.07 
 
 
434 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  35.27 
 
 
432 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>