More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1703 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
545 aa  1114    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  64.53 
 
 
560 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  58.53 
 
 
526 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  54.89 
 
 
537 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  58.25 
 
 
537 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  56.56 
 
 
554 aa  588  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  51.16 
 
 
519 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  31.5 
 
 
533 aa  250  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
538 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 
507 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.19 
 
 
507 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
527 aa  210  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 
521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
521 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  30.17 
 
 
539 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
525 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
477 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  29.27 
 
 
506 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.17 
 
 
510 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 
516 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 
542 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.99 
 
 
513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
529 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  27.86 
 
 
553 aa  151  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  28.09 
 
 
525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
544 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  27.37 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 
526 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 
505 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  27.3 
 
 
502 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 
537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 
485 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  28.73 
 
 
524 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
522 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  24.44 
 
 
475 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  26.39 
 
 
530 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 
485 aa  130  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  24.32 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
507 aa  126  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
515 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 
528 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  25.62 
 
 
536 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.22 
 
 
516 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  28.34 
 
 
550 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  29.22 
 
 
516 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  23.66 
 
 
760 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 
529 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
519 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  26.01 
 
 
501 aa  123  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 
529 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
529 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  27.67 
 
 
518 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.02 
 
 
506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1921  apolipoprotein N-acyltransferase  25.45 
 
 
629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0008443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.21 
 
 
506 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.71 
 
 
510 aa  121  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  25.33 
 
 
536 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  26.38 
 
 
524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  28.79 
 
 
518 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  27.25 
 
 
514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  25.44 
 
 
487 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
512 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  29.08 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  30.74 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  26 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
589 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  28.57 
 
 
508 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
535 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
512 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 
537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
504 aa  116  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  25.65 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  22.47 
 
 
536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  28.35 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  27.63 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  29.8 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  28.32 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  28.91 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
511 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  23.74 
 
 
536 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  25.86 
 
 
530 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  23.58 
 
 
534 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  27.85 
 
 
506 aa  114  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  25.87 
 
 
509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>