More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0001 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 491 aa  1016    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  78.26 
 
 		 489 aa  791    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  81.97 
 
 		 492 aa  811    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  85.54 
 
 		 487 aa  870    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  77.42 
 
 		 491 aa  749    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  76.02 
 
 		 492 aa  772    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  84.93 
 
 		 490 aa  846    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.24 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.6 
 
 		 503 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.95 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  45.71 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.19 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.19 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.26 
 
 		 477 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  43.43 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  42 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  40.51 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.3 
 
 		 443 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.01 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.61 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  41.85 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  42.01 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.92 
 
 		 446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.34 
 
 		 463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  42.01 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  41.85 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  39.29 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.32 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  40.4 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  42.12 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  39.44 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  39.44 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  38.16 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  39 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 462 aa  351  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  39 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  39.48 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.48 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.91 
 
 		 462 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0001  chromosomal replication initiation protein  38.35 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000560056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  39.78 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.78 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.5 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  38.78 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  40.3 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.69 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.66 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  38.61 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  41 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  39.43 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  38.91 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  38.31 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  38.83 
 
 		 458 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  38.91 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  38.04 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  37.74 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  38.04 
 
 		 460 aa  346  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.32 
 
 		 483 aa  345  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.7 
 
 		 461 aa  345  8.999999999999999e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 449 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  39.2 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  38.58 
 
 		 451 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  38.28 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.8 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  39.02 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 		 459 aa  342  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  38.18 
 
 		 457 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.49 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  37.8 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.01 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.57 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>