289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0213 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  64.24 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  63.58 
 
 		 149 aa  201  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  63.58 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1755  hypothetical protein  46.36 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0940  hypothetical protein  45.03 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0533  protein of unknown function DUF163  44.37 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000694235  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0250  hypothetical protein  49.67 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18043  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0536  hypothetical protein  48.97 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1172  hypothetical protein  40.13 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  27.1 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  26.45 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  25.81 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  41.11 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  27.74 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  34.18 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  32.3 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  45.88 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  34.48 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  30.72 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  28.21 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  27.56 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  31.61 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  42.35 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  33.96 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  30.32 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  36.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  44.83 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  32.5 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  38.82 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  29.68 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  33.06 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  31.9 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  30 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  31.82 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  28.12 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  27.45 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  33.83 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  34.83 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  33.83 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  44.83 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  44.83 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  43.53 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  29.03 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  37.21 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  28.48 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  41.38 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  36.05 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  24.52 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  44.83 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  38.24 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  40.45 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  26.28 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  45.24 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  36.04 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  46.51 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>