More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0077 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0077  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
130 aa  258  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.298672  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2063  50S ribosomal protein L15  88.46 
 
 
130 aa  232  1e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1857  50S ribosomal protein L15  88.46 
 
 
130 aa  232  1e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1686  50S ribosomal protein L15  88.46 
 
 
130 aa  232  1e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1015  50S ribosomal protein L15  82.17 
 
 
133 aa  213  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038652  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0102  50S ribosomal protein L15  82.17 
 
 
133 aa  208  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1758  50S ribosomal protein L15  80.47 
 
 
133 aa  204  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0357402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0052  50S ribosomal protein L15  75.59 
 
 
133 aa  194  5e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.712422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1950  ribosomal protein L15  68.5 
 
 
134 aa  181  2e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0304  50S ribosomal protein L15  67.97 
 
 
132 aa  180  5e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.888542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  52.21 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  43.9 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  43.65 
 
 
147 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  42.75 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  46.3 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  46.3 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.45 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.11424e-05  hitchhiker  3.39891e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.09 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  44.44 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  44 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  42.86 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  44.95 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  40.31 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  43.88 
 
 
162 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.52258e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  45.67 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  44.04 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  46.85 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  41.55 
 
 
146 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  42.06 
 
 
146 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0494  50S ribosomal protein L15P  46.08 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  44.53 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3930  50S ribosomal protein L15  46.08 
 
 
144 aa  84.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  44.04 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  40.8 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  45.3 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  41.86 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  7.85215e-06  unclonable  2.30267e-12 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  43.08 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  4.84025e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  39.2 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.14268e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  39.2 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.13012e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  39.2 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.30291e-10  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3278  50S ribosomal protein L15  42.31 
 
 
143 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1219  hitchhiker  0.000182201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  41.67 
 
 
143 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  44.25 
 
 
146 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  39.2 
 
 
149 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.54 
 
 
145 aa  84  7e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  43.65 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  43.65 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.32499e-08 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  38.76 
 
 
143 aa  83.2  1e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  40.94 
 
 
144 aa  83.2  1e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.56874e-05  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  45.87 
 
 
144 aa  82.8  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.59726e-05  hitchhiker  1.62231e-11 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  40.74 
 
 
176 aa  82.8  1e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  63.08 
 
 
143 aa  83.2  1e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  38.76 
 
 
143 aa  83.2  1e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.2076e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  41.73 
 
 
144 aa  82.8  2e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3000  50S ribosomal protein L15  42.31 
 
 
143 aa  82  2e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0225964  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0400  50S ribosomal protein L15  45.19 
 
 
143 aa  82.4  2e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  38.76 
 
 
146 aa  82.8  2e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  44.26 
 
 
147 aa  82.4  2e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.74697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0392  50S ribosomal protein L15  45.19 
 
 
143 aa  82.4  2e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0068073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  40.16 
 
 
165 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  40.16 
 
 
165 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  40.16 
 
 
165 aa  82  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  40.16 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0620  50S ribosomal protein L15  45.19 
 
 
143 aa  81.6  3e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.163377  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  41.73 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  41.73 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  38.89 
 
 
144 aa  82  3e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  39.06 
 
 
144 aa  81.3  4e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.56798e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  40.16 
 
 
144 aa  81.6  4e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
145 aa  81.3  4e-15  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  81.3  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  81.3  5e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  5e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  5e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  4.17234e-05  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  39.5 
 
 
146 aa  80.9  5e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  5e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  48.39 
 
 
146 aa  80.9  6e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
144 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3160  50S ribosomal protein L15  45.05 
 
 
144 aa  80.5  8e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  46 
 
 
157 aa  80.5  8e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  45.19 
 
 
143 aa  80.1  9e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5051  50S ribosomal protein L15  44.23 
 
 
143 aa  80.1  9e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0977317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  36.8 
 
 
144 aa  79.3  1e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.32243e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  38.76 
 
 
146 aa  79.3  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08575e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  36.8 
 
 
144 aa  79.3  1e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.73601e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  38.76 
 
 
146 aa  79.3  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.73867e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  40.74 
 
 
144 aa  80.1  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0219  50S ribosomal protein L15  36.8 
 
 
144 aa  79.3  1e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.49249e-05  hitchhiker  0.000103744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>