More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0304 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0304  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.888542  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1950  ribosomal protein L15  69.47 
 
 		 134 aa  188  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1857  50S ribosomal protein L15  70.08 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2063  50S ribosomal protein L15  70.08 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1686  50S ribosomal protein L15  70.08 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0077  50S ribosomal protein L15  67.97 
 
 		 130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.298672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0052  50S ribosomal protein L15  64.89 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.712422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0102  50S ribosomal protein L15  63.36 
 
 		 133 aa  174  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1015  50S ribosomal protein L15  63.36 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1758  50S ribosomal protein L15  64.12 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0357402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  49.56 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  43.61 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  43.38 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  44.8 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  44.63 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  43.08 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  44.36 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  48.18 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  48.18 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  48.18 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  44.8 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  51.04 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  41.79 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  59.76 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  51.04 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  51.04 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  48.84 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  45.13 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  47.79 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  47.79 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  55.79 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  45.8 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484025 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  46.72 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  61.84 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  44.07 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  44.07 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  43.94 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  48.48 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  39.71 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  39.71 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  50.53 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3278  50S ribosomal protein L15  45.04 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1219  hitchhiker  0.000182201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  41.35 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  45.13 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  42.54 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  58.97 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  39.26 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  42.22 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0072  50S ribosomal protein L15  63.24 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0620  50S ribosomal protein L15  47.47 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.163377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  46.79 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  46.79 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0342  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00281709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3298  50S ribosomal protein L15  57.69 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3000  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0225964  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  40.6 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  62.32 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  42.86 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3160  50S ribosomal protein L15  57.69 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  46.02 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  45.13 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0424  50S ribosomal protein L15  62.32 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>