More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1950 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1950  ribosomal protein L15  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1015  50S ribosomal protein L15  72.52 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1758  50S ribosomal protein L15  70.23 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0357402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1857  50S ribosomal protein L15  73.23 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2063  50S ribosomal protein L15  73.23 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0304  50S ribosomal protein L15  69.47 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.888542  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1686  50S ribosomal protein L15  73.23 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0052  50S ribosomal protein L15  67.94 
 
 		 133 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.712422  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0077  50S ribosomal protein L15  68.5 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.298672  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0102  50S ribosomal protein L15  65.91 
 
 		 133 aa  179  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.7 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  48.78 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  48.39 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.22 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  47.24 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  54.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  44.19 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  43.48 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  45.04 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  43.2 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  43.09 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3160  50S ribosomal protein L15  46.77 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  45.3 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  53.68 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  41.74 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3298  50S ribosomal protein L15  45.97 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  39.84 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0392  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0068073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  44.35 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  45.69 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3000  50S ribosomal protein L15  46.15 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0225964  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3788  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.209885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0412  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000458392  hitchhiker  0.00000250457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2306  ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.494607  normal  0.411857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0620  50S ribosomal protein L15  43.65 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.163377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03103  hypothetical protein  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00739395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  43.48 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  43.48 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  45.69 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3495  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000708831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  46.61 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  65.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  42.06 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0400  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  43.7 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  66.18 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  67.65 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  43.7 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  48.96 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  45.53 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  42.75 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3278  50S ribosomal protein L15  51.96 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1219  hitchhiker  0.000182201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  42.74 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  42.74 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0424  50S ribosomal protein L15P  42.75 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41995  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  44.35 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  43.55 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  43.55 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  43.55 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  43.55 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2045  50S ribosomal protein L15  45.31 
 
 		 184 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0169229  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  51.58 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3319  50S ribosomal protein L15  50.53 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 176 aa  90.5  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  53.19 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  63.77 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  43.94 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  46.55 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  40.44 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3803  50S ribosomal protein L15  50.54 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000421274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>