More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0102 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0102  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0052  50S ribosomal protein L15  82.44 
 
 		 133 aa  215  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.712422  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0077  50S ribosomal protein L15  82.17 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.298672  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1686  50S ribosomal protein L15  81.4 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1857  50S ribosomal protein L15  81.4 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2063  50S ribosomal protein L15  81.4 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1015  50S ribosomal protein L15  76.69 
 
 		 133 aa  202  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1758  50S ribosomal protein L15  75.94 
 
 		 133 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0357402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1950  ribosomal protein L15  65.91 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0304  50S ribosomal protein L15  63.36 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.888542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  45.31 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  47.58 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  47.83 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  47.2 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  44.35 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  43.75 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  44.92 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  44.92 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  43.51 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  43.65 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  54.08 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  44.35 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  40.91 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  41.67 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2306  ribosomal protein L15  39.13 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000818267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  43.8 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  43.61 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  42.42 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  40.46 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  43.97 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  43.48 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  42.06 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04501  50S ribosomal protein L15  43.64 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2150  ribosomal protein L15  41.73 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0266224  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.04 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  45.53 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  45.69 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0775  50S ribosomal protein L15  45.61 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.522908  normal  0.0114121 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  43.09 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  41.22 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  40 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  40.15 
 
 		 167 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  39.84 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  44.35 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  39.86 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.35 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  44.83 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  40.46 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  49.49 
 
 		 178 aa  83.6  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  42.54 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  39.71 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  44.35 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0513  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155544  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0452  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.37926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  38.35 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  40.32 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  38.71 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  41.94 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  39.39 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  38.17 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  38.17 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  43.97 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  43.97 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  57.97 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  40.15 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  49.48 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  41.3 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  41.3 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  48 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  41.74 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  49.47 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  40.87 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  41.38 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  41.54 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  41.44 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1927  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>