222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0007 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  82.57 
 
 
412 aa  718  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  100 
 
 
416 aa  855  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  82.57 
 
 
412 aa  718  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  51.61 
 
 
457 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.31 
 
 
417 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.08 
 
 
411 aa  417  1e-115  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  51.57 
 
 
410 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  45.59 
 
 
408 aa  357  2e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.42 
 
 
408 aa  355  9e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.71 
 
 
408 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  44.83 
 
 
420 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  48.42 
 
 
408 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  45.34 
 
 
408 aa  346  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  44.88 
 
 
408 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  43.13 
 
 
461 aa  339  6e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  42.89 
 
 
461 aa  338  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  41.2 
 
 
451 aa  312  7e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.14 
 
 
453 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  34.7 
 
 
412 aa  198  2e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.04 
 
 
414 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.85 
 
 
417 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.46 
 
 
410 aa  190  3e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  31.18 
 
 
406 aa  185  1e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.14 
 
 
402 aa  185  1e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.31 
 
 
403 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.88 
 
 
401 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.38 
 
 
406 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.84 
 
 
408 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  29.98 
 
 
401 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.69 
 
 
414 aa  176  1e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.11 
 
 
446 aa  175  1e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.9 
 
 
403 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.29 
 
 
405 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.29 
 
 
405 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.38 
 
 
426 aa  166  6e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.02 
 
 
402 aa  165  1e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.05 
 
 
361 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 
407 aa  162  8e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  30.85 
 
 
367 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  29.27 
 
 
359 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.12 
 
 
409 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.76 
 
 
400 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.16 
 
 
412 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.23 
 
 
416 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  31.92 
 
 
379 aa  154  3e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
402 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.33 
 
 
407 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.07 
 
 
370 aa  147  4e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  29.24 
 
 
414 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  28.31 
 
 
369 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.3 
 
 
406 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 
417 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.51 
 
 
369 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
372 aa  136  7e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.02 
 
 
369 aa  136  7e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.6 
 
 
434 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.2 
 
 
369 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.02 
 
 
415 aa  129  1e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  24.05 
 
 
363 aa  127  4e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.43 
 
 
409 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.46 
 
 
376 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  26.51 
 
 
600 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  29.89 
 
 
409 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.7 
 
 
405 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  27.97 
 
 
428 aa  115  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  27.97 
 
 
428 aa  115  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.99 
 
 
400 aa  114  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.5 
 
 
407 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.98 
 
 
414 aa  112  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  29.72 
 
 
1016 aa  112  1e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  31.68 
 
 
449 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.03 
 
 
409 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  31.35 
 
 
451 aa  110  7e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  31.35 
 
 
445 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.54 
 
 
415 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  27.07 
 
 
429 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  28.9 
 
 
349 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30 
 
 
453 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  30.35 
 
 
448 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.83 
 
 
425 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  25.75 
 
 
380 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  26.38 
 
 
419 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.69 
 
 
501 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.77 
 
 
437 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.63 
 
 
418 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  27.08 
 
 
424 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.63 
 
 
418 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  27.94 
 
 
891 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  28.47 
 
 
423 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  26.13 
 
 
419 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  25 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 
425 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  27.27 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  27.52 
 
 
440 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  27.3 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  25.83 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  27.3 
 
 
425 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  27.11 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.88 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  27.78 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>