123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1666 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
348 aa  667    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  58.82 
 
 
328 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  58.33 
 
 
313 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  50.49 
 
 
318 aa  272  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  47.38 
 
 
320 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  46.23 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  40.92 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  41.47 
 
 
325 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  38.92 
 
 
386 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 
323 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  41.18 
 
 
351 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.08 
 
 
338 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  40.94 
 
 
329 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.72 
 
 
287 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  41.28 
 
 
326 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  39.07 
 
 
351 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  43.45 
 
 
309 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  41.38 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  37 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  38.73 
 
 
337 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  41.49 
 
 
351 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  39.61 
 
 
322 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  38.82 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  39.1 
 
 
301 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  40.2 
 
 
305 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  36.13 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  39.76 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  39.51 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  35.22 
 
 
304 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  37.23 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  36.21 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  36.21 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
342 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  39.41 
 
 
318 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  37.29 
 
 
331 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  39.11 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  37.62 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  28.78 
 
 
622 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  34.08 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  33.52 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  32.98 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  31.65 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.57 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  34.59 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  29.22 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.21 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  28.07 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  30.56 
 
 
367 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  28.76 
 
 
288 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  27.81 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  26.79 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  26.79 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  30.6 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  26.79 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.33 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  26.14 
 
 
317 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  34.72 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  32.49 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  24.84 
 
 
311 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  30.1 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  31.01 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  30.73 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  24.49 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  33.86 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  32.26 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  32.49 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  33.86 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  33.86 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  33.86 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  32.71 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.19 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  33.86 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.55 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.46 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  29.77 
 
 
327 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  34.53 
 
 
307 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  26.92 
 
 
285 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  34.4 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.06 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  35.34 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  33.87 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  33.87 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  33.61 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>