More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1388 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 117 aa  226  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  65.52 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  57.26 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  56.64 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  54.31 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  54.46 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  58.44 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  42.57 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  50.6 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  32.46 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  33.9 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  41.53 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  44.3 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  46.05 
 
 		 554 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  31.86 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  36.9 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  42.7 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  34.15 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 507 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  36.21 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  25.64 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  27.97 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  36.21 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 470 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  35.34 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  31.58 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  49.33 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  41.89 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  37.21 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 475 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  44.05 
 
 		 511 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>