More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2926 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  100 
 
 
389 aa  798  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  73.52 
 
 
391 aa  616  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  52.37 
 
 
386 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  52.89 
 
 
386 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  53.93 
 
 
373 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  52.45 
 
 
370 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  53.39 
 
 
373 aa  407  1e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  51.95 
 
 
390 aa  406  1e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  53.26 
 
 
373 aa  407  1e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  50 
 
 
373 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  50.82 
 
 
373 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  49.73 
 
 
380 aa  389  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  48.02 
 
 
388 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  49.73 
 
 
389 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  49.34 
 
 
390 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  48.4 
 
 
379 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  48.78 
 
 
371 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  45.92 
 
 
369 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  46.9 
 
 
377 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  47.34 
 
 
390 aa  362  9e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  47.17 
 
 
380 aa  358  1e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  44.95 
 
 
390 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  45.79 
 
 
391 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  45.53 
 
 
391 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  45.53 
 
 
391 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  45.26 
 
 
391 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  44.74 
 
 
391 aa  337  2e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  44.74 
 
 
391 aa  337  2e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  44.47 
 
 
391 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  44.17 
 
 
370 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  44.33 
 
 
392 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  44.47 
 
 
391 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  44.21 
 
 
391 aa  327  2e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  46.87 
 
 
380 aa  320  2e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  45.63 
 
 
851 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  44.27 
 
 
408 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  44.44 
 
 
398 aa  315  1e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  40.31 
 
 
387 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  42.12 
 
 
375 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  42.37 
 
 
433 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  42.48 
 
 
380 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  42.05 
 
 
384 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  40.63 
 
 
384 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  39.25 
 
 
395 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  42.04 
 
 
388 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.78 
 
 
395 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  39.78 
 
 
395 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  41.41 
 
 
389 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  41.41 
 
 
389 aa  286  6e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  40.1 
 
 
389 aa  285  1e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  42.4 
 
 
379 aa  283  2e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.97 
 
 
382 aa  283  4e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.43 
 
 
379 aa  283  5e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.53 
 
 
403 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.21 
 
 
403 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  40.1 
 
 
389 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  40.1 
 
 
389 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  39.84 
 
 
389 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  39.84 
 
 
389 aa  278  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  39.84 
 
 
389 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  39.3 
 
 
395 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.84 
 
 
389 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.58 
 
 
389 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.58 
 
 
389 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  38.03 
 
 
393 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  42.9 
 
 
811 aa  275  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  39.73 
 
 
395 aa  275  1e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.59 
 
 
364 aa  274  2e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  39.47 
 
 
395 aa  273  5e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  39.84 
 
 
403 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  40.85 
 
 
375 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  39.79 
 
 
376 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  39.57 
 
 
374 aa  263  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  37 
 
 
406 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.08 
 
 
378 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  38.4 
 
 
441 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  38.67 
 
 
374 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  42.26 
 
 
373 aa  261  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  37.99 
 
 
434 aa  259  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.92 
 
 
411 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  38.44 
 
 
365 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.61 
 
 
379 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  38.59 
 
 
402 aa  252  9e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.61 
 
 
379 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  42.28 
 
 
844 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  38.13 
 
 
421 aa  249  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  38.71 
 
 
364 aa  249  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  40.38 
 
 
849 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  34.38 
 
 
387 aa  246  5e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  37.14 
 
 
382 aa  244  1e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  38.28 
 
 
382 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  35.45 
 
 
376 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  38.28 
 
 
382 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  34.91 
 
 
397 aa  240  3e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  36.78 
 
 
375 aa  239  6e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  38.12 
 
 
402 aa  239  6e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  37.53 
 
 
397 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  38.92 
 
 
386 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  36.87 
 
 
380 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  37.27 
 
 
366 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>