More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1430 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  57.5 
 
 
594 aa  695    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  53.46 
 
 
602 aa  641    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  100 
 
 
592 aa  1211    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  49.49 
 
 
597 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
598 aa  597  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  46.56 
 
 
597 aa  542  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  44.65 
 
 
609 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  43.93 
 
 
598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  45.76 
 
 
593 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.63 
 
 
589 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
594 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  41.91 
 
 
608 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  42.21 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  41.71 
 
 
620 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  41.86 
 
 
617 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  41.24 
 
 
617 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  41.51 
 
 
620 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.6 
 
 
598 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.83 
 
 
597 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.83 
 
 
597 aa  430  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  40.24 
 
 
600 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  39.55 
 
 
590 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.42 
 
 
598 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.25 
 
 
598 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.25 
 
 
598 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.54 
 
 
598 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  37.54 
 
 
602 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  38.37 
 
 
598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.37 
 
 
598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.37 
 
 
598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  38.57 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.37 
 
 
598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 
622 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.98 
 
 
600 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
603 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  37.67 
 
 
587 aa  418  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  40.32 
 
 
613 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.28 
 
 
592 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  40.77 
 
 
613 aa  415  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  39.43 
 
 
625 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.18 
 
 
611 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  37.26 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 
602 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  37.77 
 
 
602 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  38.28 
 
 
631 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 
605 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.96 
 
 
609 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  39.02 
 
 
607 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  38.03 
 
 
588 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  41.46 
 
 
625 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.87 
 
 
637 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  37.65 
 
 
626 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  36.75 
 
 
625 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.9 
 
 
610 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  38.09 
 
 
584 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  37.41 
 
 
636 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.81 
 
 
635 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.97 
 
 
594 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.61 
 
 
637 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  36.13 
 
 
591 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.24 
 
 
637 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  39.22 
 
 
601 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  37.46 
 
 
614 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
586 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  37.78 
 
 
588 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.59 
 
 
608 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.86 
 
 
623 aa  395  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.29 
 
 
618 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.61 
 
 
618 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  39.88 
 
 
652 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.82 
 
 
589 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.73 
 
 
606 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  36.24 
 
 
616 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.24 
 
 
592 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 
587 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  39.27 
 
 
628 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  42.66 
 
 
650 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
618 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  38.32 
 
 
628 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  41.73 
 
 
671 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  36.83 
 
 
611 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  37.22 
 
 
582 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  38.22 
 
 
624 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  38.04 
 
 
594 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  36.63 
 
 
587 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  36.72 
 
 
587 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 
587 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
811 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.72 
 
 
587 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  37.04 
 
 
640 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.72 
 
 
587 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.33 
 
 
632 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.9 
 
 
634 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  36.95 
 
 
625 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.86 
 
 
635 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  38.79 
 
 
615 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.52 
 
 
587 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  38.43 
 
 
603 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>