More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0030 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  390  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  58.9 
 
 
178 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  54.02 
 
 
203 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  53.89 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  53.8 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  52.35 
 
 
204 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  51.76 
 
 
204 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  51.18 
 
 
204 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  53.12 
 
 
196 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  52.26 
 
 
207 aa  147  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  46.88 
 
 
263 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  43.33 
 
 
219 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  43.33 
 
 
219 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  49.44 
 
 
225 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  49.02 
 
 
260 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  45.71 
 
 
286 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  42.7 
 
 
224 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  47.24 
 
 
259 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  46.84 
 
 
262 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  46.79 
 
 
253 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  46.5 
 
 
259 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  44.44 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  47.77 
 
 
272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  39.89 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  41.08 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  41.57 
 
 
314 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  46 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  40.44 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  41.24 
 
 
255 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  45.06 
 
 
201 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  42.68 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  43.5 
 
 
207 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  42.42 
 
 
238 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  43.15 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  41.4 
 
 
205 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  43.72 
 
 
181 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  43.87 
 
 
201 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  42.38 
 
 
153 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  42.04 
 
 
204 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  44.3 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  44.3 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  44.52 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  40.51 
 
 
279 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  42.25 
 
 
152 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  42.25 
 
 
152 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  39.53 
 
 
153 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.19 
 
 
158 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  41.38 
 
 
153 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  40.94 
 
 
153 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  36.96 
 
 
152 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  99.8  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  36.55 
 
 
151 aa  98.6  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  46.49 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  46.49 
 
 
152 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  46.85 
 
 
145 aa  98.2  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  38.69 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  45.61 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  45.61 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.8 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.67 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  36.72 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  36.72 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  44.74 
 
 
158 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  45.95 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  39.58 
 
 
166 aa  95.9  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  35.17 
 
 
151 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  42.98 
 
 
152 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  35.94 
 
 
165 aa  95.5  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.17 
 
 
151 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  30.47 
 
 
152 aa  94.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.94 
 
 
151 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  39.32 
 
 
151 aa  94.4  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  37.01 
 
 
154 aa  94.4  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  41.5 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  43.97 
 
 
150 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  30.47 
 
 
152 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  45.05 
 
 
173 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  38.36 
 
 
156 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  36.72 
 
 
151 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  36.96 
 
 
154 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  43.97 
 
 
153 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  35.94 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.16 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  35.94 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  35.94 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  34.59 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  35.94 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  36.72 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  38.58 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  38.28 
 
 
153 aa  92  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  39.2 
 
 
161 aa  91.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  36.62 
 
 
140 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  38.78 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  34.72 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>