42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0477 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  100 
 
 
368 aa  744    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  64.71 
 
 
367 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  62.22 
 
 
380 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  58.61 
 
 
362 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  54.17 
 
 
397 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  45.58 
 
 
390 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  42.05 
 
 
397 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  43.05 
 
 
395 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  41.64 
 
 
398 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  42.93 
 
 
397 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  42.2 
 
 
397 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  40.06 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  44.15 
 
 
398 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  44.15 
 
 
398 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  41.74 
 
 
419 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  42.11 
 
 
388 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  32.95 
 
 
379 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  30.99 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  26.6 
 
 
652 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.87 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.91 
 
 
711 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.8 
 
 
1079 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.17 
 
 
487 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  23.96 
 
 
503 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.72 
 
 
1030 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
850 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  28.33 
 
 
470 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  29.24 
 
 
639 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  23.85 
 
 
581 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.24 
 
 
522 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  27.09 
 
 
623 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.22 
 
 
1146 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.72 
 
 
1351 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
493 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.62 
 
 
498 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28 
 
 
1163 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.9 
 
 
831 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.09 
 
 
1750 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  27.98 
 
 
1046 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
732 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  23.15 
 
 
504 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  24.62 
 
 
686 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>