More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6078 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  100 
 
 
414 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  55.42 
 
 
411 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  43.28 
 
 
410 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.44 
 
 
405 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.11 
 
 
402 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.01 
 
 
401 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.66 
 
 
411 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.9 
 
 
412 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.48 
 
 
407 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  41.48 
 
 
407 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  41.48 
 
 
407 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.24 
 
 
405 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  38.37 
 
 
409 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  41.03 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  39.17 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.28 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  38.61 
 
 
411 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.01 
 
 
411 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  38.37 
 
 
411 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.01 
 
 
411 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38.52 
 
 
411 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  38.37 
 
 
411 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.28 
 
 
411 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.04 
 
 
411 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.02 
 
 
398 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.91 
 
 
405 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  37.77 
 
 
421 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.62 
 
 
411 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  43.14 
 
 
414 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.87 
 
 
417 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.61 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.2 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.19 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.49 
 
 
423 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.69 
 
 
399 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  40.84 
 
 
400 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.61 
 
 
426 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.16 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  38.52 
 
 
419 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.82 
 
 
406 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.59 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.28 
 
 
423 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.96 
 
 
417 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  36.41 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  36.52 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.71 
 
 
423 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  38.11 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.17 
 
 
436 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.39 
 
 
408 aa  232  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.45 
 
 
407 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.83 
 
 
392 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.02 
 
 
412 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.68 
 
 
407 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.33 
 
 
420 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.82 
 
 
406 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.66 
 
 
388 aa  229  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  37.59 
 
 
405 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.85 
 
 
419 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  38.9 
 
 
404 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.8 
 
 
418 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.04 
 
 
417 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.92 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  40.4 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  38.81 
 
 
390 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.48 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  38.74 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  37.29 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.27 
 
 
402 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  34.95 
 
 
402 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.11 
 
 
417 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  37.23 
 
 
396 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  40.25 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  34.72 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  35.22 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  36.19 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  33.57 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  33.57 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.57 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.21 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.33 
 
 
399 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.2 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  36.98 
 
 
420 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  37.53 
 
 
402 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.84 
 
 
380 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.27 
 
 
402 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  36.27 
 
 
430 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.35 
 
 
402 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  37.53 
 
 
400 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  34.16 
 
 
398 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  37.22 
 
 
417 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  34.87 
 
 
414 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  38.25 
 
 
399 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.78 
 
 
406 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.14 
 
 
411 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  34.79 
 
 
402 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  34.79 
 
 
402 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  34.79 
 
 
402 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.78 
 
 
410 aa  206  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  40.96 
 
 
447 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  40.96 
 
 
447 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>