More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5551 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  50 
 
 		 412 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  45.38 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 432 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  36.39 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 		 431 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  29.1 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.78 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.78 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.54 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.54 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.44 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.67 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  28.86 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 443 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.76 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  26.99 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  26.99 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.61 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  27.32 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.33 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.69 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.34 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.56 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.58 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.32 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.11 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.42 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.11 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.99 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  29.35 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  26.04 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.3 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  25.41 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  26.29 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.56 
 
 		 1833 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  21.37 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.37 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.49 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>