More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3527 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
534 aa  1065    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  52.68 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  46.24 
 
 
554 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  51.27 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  47.94 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.22 
 
 
531 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.75 
 
 
509 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.63 
 
 
512 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  44.33 
 
 
531 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  44.26 
 
 
528 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  59.15 
 
 
546 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  44.76 
 
 
570 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.78 
 
 
525 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.87 
 
 
545 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  47.76 
 
 
531 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.15 
 
 
511 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  46.42 
 
 
524 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.76 
 
 
505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.51 
 
 
520 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.93 
 
 
521 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.32 
 
 
505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.8 
 
 
515 aa  355  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.4 
 
 
512 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.4 
 
 
512 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.4 
 
 
512 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  43.1 
 
 
538 aa  349  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.11 
 
 
508 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  51.67 
 
 
608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.79 
 
 
508 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.86 
 
 
552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.42 
 
 
532 aa  303  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  46.95 
 
 
501 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.78 
 
 
501 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.67 
 
 
465 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  31.63 
 
 
489 aa  177  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  34.11 
 
 
528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  32.34 
 
 
505 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.75 
 
 
512 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.92 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
405 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
405 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.26 
 
 
376 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  33.22 
 
 
372 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.23 
 
 
415 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.87 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.38 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.48 
 
 
409 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.54 
 
 
370 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.9 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  30.59 
 
 
407 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  32.32 
 
 
406 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
445 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.32 
 
 
402 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.84 
 
 
400 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.08 
 
 
410 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  26.56 
 
 
429 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 
414 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.67 
 
 
414 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.75 
 
 
419 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 
402 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 
403 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
338 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.01 
 
 
431 aa  104  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.62 
 
 
414 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  25.12 
 
 
451 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.7 
 
 
363 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.1 
 
 
401 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.71 
 
 
406 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  30 
 
 
424 aa  100  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 
402 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  29.47 
 
 
309 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.01 
 
 
414 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  27.5 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 
405 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 
425 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.65 
 
 
199 aa  97.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 
426 aa  97.8  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.32 
 
 
408 aa  97.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  25.93 
 
 
409 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  29.52 
 
 
419 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.26 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.61 
 
 
415 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  28.13 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  29.06 
 
 
361 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.55 
 
 
207 aa  95.1  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  29.52 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.52 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.52 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.96 
 
 
416 aa  94.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  26.18 
 
 
412 aa  94  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.14 
 
 
200 aa  94  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  25.08 
 
 
369 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.57 
 
 
437 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.6 
 
 
425 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  27.72 
 
 
407 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.11 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  26.25 
 
 
420 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  26.47 
 
 
437 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>