More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0362 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
323 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  54.17 
 
 
317 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  50.63 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 
315 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  50.63 
 
 
323 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  48.43 
 
 
322 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  46.18 
 
 
324 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  48.64 
 
 
302 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  47.04 
 
 
337 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  43.67 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  43.81 
 
 
315 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 
323 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 
341 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
328 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 
311 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.57 
 
 
334 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  41.78 
 
 
308 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  43.45 
 
 
330 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 
331 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.13 
 
 
350 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 
351 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 
344 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
331 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  37.36 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
321 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
343 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
323 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
287 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 
301 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 
297 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  34.3 
 
 
345 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
286 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
288 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
288 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
288 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
367 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.23 
 
 
293 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
289 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
290 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
291 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
300 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
297 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  32.32 
 
 
356 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
301 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
289 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
289 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
308 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
308 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
305 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  31.59 
 
 
434 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
376 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
376 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  30.92 
 
 
780 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
287 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  31.42 
 
 
371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
287 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
304 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
287 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  32.38 
 
 
311 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
288 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
349 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
292 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
307 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
305 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
294 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  31.66 
 
 
494 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
291 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
313 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
276 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.08 
 
 
313 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
291 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.56 
 
 
278 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>