More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1577 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
147 aa  300  5e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.32227e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  97.96 
 
 
147 aa  280  6e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  65.28 
 
 
364 aa  207  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  63.89 
 
 
375 aa  202  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
153 aa  200  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  64.14 
 
 
321 aa  195  2e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.76 
 
 
352 aa  195  2e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  64.58 
 
 
328 aa  193  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  65.96 
 
 
321 aa  193  8e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  61.64 
 
 
186 aa  193  8e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  65.25 
 
 
321 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  65.25 
 
 
321 aa  192  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  65.25 
 
 
321 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  65.25 
 
 
321 aa  191  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
359 aa  191  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  65.25 
 
 
321 aa  191  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  64.54 
 
 
321 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  64.54 
 
 
321 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  64.54 
 
 
321 aa  190  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  60.54 
 
 
150 aa  188  3e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  63.83 
 
 
321 aa  187  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  62.24 
 
 
147 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  61.81 
 
 
147 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  63.89 
 
 
380 aa  186  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  61.64 
 
 
323 aa  186  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  59.03 
 
 
381 aa  186  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  61.81 
 
 
146 aa  186  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  61.81 
 
 
146 aa  186  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  60.96 
 
 
320 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  63.01 
 
 
144 aa  186  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  62.69 
 
 
157 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  60.28 
 
 
368 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  60.69 
 
 
202 aa  185  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  65.15 
 
 
153 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  65.38 
 
 
148 aa  184  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  57.93 
 
 
152 aa  183  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  57.34 
 
 
385 aa  181  2e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  58.22 
 
 
348 aa  181  2e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  53.19 
 
 
735 aa  181  2e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  64.39 
 
 
153 aa  181  4e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  64.39 
 
 
153 aa  181  4e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  58.62 
 
 
394 aa  181  4e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  61.43 
 
 
142 aa  180  5e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  63.91 
 
 
141 aa  180  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  63.38 
 
 
142 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  63.38 
 
 
142 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.16 
 
 
311 aa  179  8e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  55.1 
 
 
154 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  65.35 
 
 
142 aa  179  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  5.68952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  60.71 
 
 
151 aa  178  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  58.74 
 
 
187 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  57.75 
 
 
144 aa  178  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  57.53 
 
 
346 aa  177  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 
142 aa  177  6e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.94 
 
 
316 aa  177  6e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
148 aa  176  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  54.74 
 
 
405 aa  176  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 
148 aa  175  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  59.72 
 
 
148 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  59.03 
 
 
181 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.65676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  60.77 
 
 
148 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  57.93 
 
 
158 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  57.53 
 
 
155 aa  174  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  55.63 
 
 
337 aa  172  1e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  56.94 
 
 
380 aa  172  2e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.85 
 
 
317 aa  172  2e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  60.77 
 
 
150 aa  171  2e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.68 
 
 
611 aa  171  3e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  52.41 
 
 
212 aa  169  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  58.16 
 
 
141 aa  169  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  51.03 
 
 
290 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  55.1 
 
 
151 aa  167  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  55.8 
 
 
329 aa  167  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  3.14472e-05  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  56.16 
 
 
368 aa  167  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  59.57 
 
 
167 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  59.57 
 
 
167 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  57.64 
 
 
147 aa  166  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  55 
 
 
351 aa  165  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  50.68 
 
 
158 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 
149 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.86 
 
 
322 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  51.05 
 
 
397 aa  163  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  51.39 
 
 
309 aa  162  1e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  57.04 
 
 
332 aa  162  1e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  54.81 
 
 
149 aa  160  8e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.95 
 
 
590 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  53.52 
 
 
353 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  55.07 
 
 
147 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 
191 aa  154  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 
206 aa  154  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.15 
 
 
416 aa  153  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  53.52 
 
 
309 aa  153  7e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  46.21 
 
 
416 aa  153  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  50 
 
 
338 aa  151  3e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 
143 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 
143 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
143 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 
143 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
143 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
143 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>