86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01720 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  55.62 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  55.76 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  49.39 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  49.1 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  36.62 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  35.92 
 
 		 151 aa  84.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  33.09 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  34.38 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  30.71 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  35 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  30.28 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  32.52 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  33.1 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  33.8 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  33.8 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  33.8 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  29.58 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  31.06 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  27.03 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  31.06 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  29.41 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  30 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  29.63 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  32.86 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  28.75 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  29.08 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  32.37 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  31.15 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  28.06 
 
 		 154 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 110 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  29.25 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  32.88 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  32.26 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  25.55 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  32.14 
 
 		 113 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0058  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 109 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000680937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0272  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00175067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3771  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0254  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00176884  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0332  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268169  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0055  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185707  hitchhiker  6.04207e-20 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0281  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617614  normal  0.0696934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2835  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000576673  normal  0.189741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2627  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00739317  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2754  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000226308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0353  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000911683  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3164  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000561791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1929  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000352349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3452  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000048605  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3741  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000060357  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3799  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3483  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3063  50S ribosomal protein L22  39.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000747087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 111 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  26.49 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3312  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000860749  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 111 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 111 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  36.59 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  30.99 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3790  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  30.43 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3014  50S ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000615248  decreased coverage  0.00191029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0772  50S ribosomal protein L22  31.43 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.151637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2023  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.734149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3639  50S ribosomal protein L22  38.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000767694  hitchhiker  0.0000000000152117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0319  50S ribosomal protein L22  36.51 
 
 		 109 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000843576  decreased coverage  0.00242293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 112 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  35.38 
 
 		 109 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  27.94 
 
 		 110 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  33.82 
 
 		 110 aa  41.2  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>