286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2256 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 348 aa  725    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5524  hypothetical protein  54.94 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608927  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  38.22 
 
 		 303 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  37.29 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  40.16 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  36.61 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  38.25 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  35.93 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.48 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  35.81 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  34.96 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  34.96 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.48 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  31.54 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.16 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.16 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.16 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.16 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  33.94 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  37.05 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  32.64 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  30.42 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  31.94 
 
 		 361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  34.87 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.45 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  35.16 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  35.68 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  31.13 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.29 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  35.16 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  31.74 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  29.9 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.6 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.56 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  32.38 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  30.09 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  29.43 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.71 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.66 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  32.46 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  32.98 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  27.93 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  31.71 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  31.82 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.34 
 
 		 362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  29.17 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  30.8 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  32.77 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  29.09 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  29.81 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  29.24 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  29.96 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  29.55 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  29.96 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  29.39 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  30.6 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  32.4 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  30.25 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  28.09 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  31.37 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.46 
 
 		 590 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  28.75 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  31.15 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  29.56 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.21 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1825  outer membrane protein  31.76 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.18 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  31.02 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  27.8 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  30.21 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  30.57 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  29.58 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  31.5 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 		 374 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  27.18 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  29.81 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.29 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  28.62 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  27.18 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  30.74 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  29.69 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  29.69 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  29.69 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  30.58 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>