More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1987 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.75 
 
 
577 aa  705    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
577 aa  1163    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.96 
 
 
555 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 
604 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 
566 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  42.57 
 
 
586 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
612 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
612 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
608 aa  216  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
597 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  25.59 
 
 
762 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
754 aa  193  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
755 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
758 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
752 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  23.54 
 
 
595 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  28.18 
 
 
581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  25.95 
 
 
595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
593 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  26.89 
 
 
596 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
456 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
885 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
592 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
899 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  30.92 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  27.19 
 
 
595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  30.41 
 
 
613 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
593 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  27.98 
 
 
581 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
763 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
611 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
581 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  23.13 
 
 
595 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
619 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
899 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
650 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
594 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
593 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  30.24 
 
 
598 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
608 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  30.63 
 
 
613 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  30.63 
 
 
613 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  27.5 
 
 
608 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  30.41 
 
 
613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  30.41 
 
 
613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  30.41 
 
 
613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  30.41 
 
 
613 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
613 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  28.02 
 
 
591 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
621 aa  174  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
623 aa  173  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 
593 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
604 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  29.4 
 
 
689 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
584 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  28.85 
 
 
688 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
581 aa  171  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
612 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  27.27 
 
 
610 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
589 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  28.41 
 
 
689 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
625 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
669 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
607 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  28.82 
 
 
688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
621 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
582 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
688 aa  167  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  25.64 
 
 
598 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  27.88 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  30.37 
 
 
689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
944 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  29.91 
 
 
689 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
608 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
609 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
893 aa  163  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.04 
 
 
587 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
640 aa  163  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
587 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
3470 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
634 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 
591 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
608 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
615 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.81 
 
 
587 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
571 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  28.81 
 
 
587 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
489 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  28.81 
 
 
587 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
645 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.81 
 
 
587 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>