266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1569 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 161 aa  339  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  52.2 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 162 aa  170  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  48.15 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 219 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  46.54 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.4 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 167 aa  146  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  43.83 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  44.72 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  40.72 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  44.81 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  40.88 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  47.2 
 
 		 306 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 186 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  43.48 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>