More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1353 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  100 
 
 		 98 aa  204  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  56.12 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  58.95 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  52.04 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  55.79 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  44.33 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  50.63 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  45.36 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44.21 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  45.92 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  45.92 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  50.59 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  43.16 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  43.01 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  50 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  50.57 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40.82 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40.82 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40.82 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.75 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40.82 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40.82 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40.82 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40.82 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  47.19 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  42.11 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  44.33 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  40.82 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  47.19 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.49 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  38.78 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  40 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  42.86 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  38.78 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  38.78 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  48.35 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  42.39 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.84 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  41.84 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  52.56 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  44.09 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  44.09 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  48.39 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.33 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  44.57 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  40.66 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  38.95 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  40.62 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  40.66 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40.62 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  37.76 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  37.76 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  42.55 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  40.86 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.58 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  45.88 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  42.22 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  45.45 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  45.35 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  39.78 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  45.16 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  46.94 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  41.24 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  41.49 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  42.7 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  40.86 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  44.68 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  38.71 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  45.05 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  44.44 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  43.3 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  43.33 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  46.15 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  39.58 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.96 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  41.84 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  42.71 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  44.94 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>