More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0179 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  100 
 
 		 376 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  55.43 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  56.01 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  55.69 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  48.1 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  43.54 
 
 		 391 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  54.26 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  43.92 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  47.09 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  37.37 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  44.53 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  43.08 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  40.94 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  41.46 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  46.58 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  47.19 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  45.54 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  45.75 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  46.23 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  35.51 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.6 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  37.82 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  35.42 
 
 		 263 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 		 284 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  34.1 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  34.02 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  34.27 
 
 		 283 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  35.1 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  32.89 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  32.33 
 
 		 243 aa  106  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  32.26 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  36.18 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  36.04 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.8 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  35.59 
 
 		 250 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  34.33 
 
 		 248 aa  103  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 		 249 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  36.02 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.21 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  30.34 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  31.2 
 
 		 283 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 		 261 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.09 
 
 		 247 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  34.22 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.88 
 
 		 251 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  34.3 
 
 		 259 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  31.93 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.65 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.36 
 
 		 339 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.07 
 
 		 253 aa  97.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  32.66 
 
 		 260 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 		 250 aa  96.3  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  34.02 
 
 		 261 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  33.91 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.9 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.87 
 
 		 263 aa  94.4  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  33.06 
 
 		 249 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  34.93 
 
 		 282 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  36.7 
 
 		 257 aa  94  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  34.83 
 
 		 234 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  27.67 
 
 		 247 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  35.9 
 
 		 248 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  28.17 
 
 		 247 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 		 249 aa  92.8  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 		 249 aa  92.8  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  33.51 
 
 		 267 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 		 249 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  32.42 
 
 		 250 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  32.49 
 
 		 252 aa  92  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34.09 
 
 		 234 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 250 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 		 241 aa  89  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  30.81 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  32.95 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.78 
 
 		 261 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  30.63 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  27.91 
 
 		 249 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  29.54 
 
 		 270 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 		 216 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  31.91 
 
 		 262 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  29.56 
 
 		 280 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.36 
 
 		 229 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  32.2 
 
 		 276 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  29.67 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  29.31 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  30.63 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>