More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0361 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  78.92 
 
 
185 aa  300  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  77.84 
 
 
185 aa  297  7e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  77.3 
 
 
185 aa  296  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  77.3 
 
 
185 aa  295  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  73.51 
 
 
185 aa  285  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2111  ribosome recycling factor  72.97 
 
 
185 aa  283  7e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.274571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1781  ribosome recycling factor  71.89 
 
 
185 aa  275  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  70.11 
 
 
186 aa  246  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2067  ribosome recycling factor  53.51 
 
 
185 aa  210  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  47.03 
 
 
185 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  46.2 
 
 
185 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  45.95 
 
 
185 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.2 
 
 
186 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.49 
 
 
185 aa  177  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.86 
 
 
185 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  46.2 
 
 
187 aa  175  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  45.41 
 
 
186 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  42.16 
 
 
185 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  47.57 
 
 
185 aa  174  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  42.16 
 
 
185 aa  174  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  43.17 
 
 
185 aa  174  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.41 
 
 
186 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  43.86 
 
 
186 aa  173  1e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  45.51 
 
 
184 aa  173  1e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.66 
 
 
184 aa  173  1e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  45.61 
 
 
186 aa  172  2e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
185 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  42.16 
 
 
185 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  45.56 
 
 
185 aa  171  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
186 aa  171  6e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
185 aa  171  6e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
186 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  169  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  44.86 
 
 
186 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.24 
 
 
184 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.82094e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  45.4 
 
 
181 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  45.4 
 
 
181 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  47.95 
 
 
186 aa  168  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  45.09 
 
 
186 aa  168  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
186 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  45.11 
 
 
187 aa  168  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
185 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.51569e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  45.65 
 
 
184 aa  167  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
185 aa  167  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  46.7 
 
 
187 aa  167  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  41.53 
 
 
185 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
186 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  42.39 
 
 
185 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  41.08 
 
 
185 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
186 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  41.3 
 
 
184 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
186 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  46.82 
 
 
186 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
186 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  46.82 
 
 
186 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  43.72 
 
 
185 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  41.62 
 
 
185 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.79866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  41.08 
 
 
187 aa  165  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  40.46 
 
 
187 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
185 aa  164  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
186 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  42.61 
 
 
182 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  40.54 
 
 
185 aa  164  6e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  39.46 
 
 
185 aa  164  7e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
185 aa  164  7e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  43.93 
 
 
186 aa  163  1e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  45.61 
 
 
185 aa  163  1e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  41.28 
 
 
184 aa  163  1e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  48.37 
 
 
185 aa  162  2e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  41.48 
 
 
182 aa  162  2e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
186 aa  162  2e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  41.08 
 
 
185 aa  162  2e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.66075e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  45.14 
 
 
186 aa  162  2e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  46.78 
 
 
188 aa  162  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  47.34 
 
 
187 aa  162  2e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  45.03 
 
 
186 aa  162  2e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  40.44 
 
 
185 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
186 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  40.76 
 
 
185 aa  162  4e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
185 aa  161  4e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.6264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  42.16 
 
 
185 aa  161  5e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  42.7 
 
 
185 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  39.46 
 
 
185 aa  161  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>