81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1749 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  100 
 
 		 435 aa  856    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  69.56 
 
 		 455 aa  599  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  65.75 
 
 		 432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  69.69 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  55.05 
 
 		 433 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  54.92 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  55.05 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  52.76 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  55.5 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  49.32 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  50.56 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  47.15 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  46.7 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  46.92 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  46.7 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  46.7 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  46.27 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  46.92 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  46.7 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  46.7 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  46.7 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  46.24 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  47.47 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  46.47 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  48.13 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  46.79 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  48.31 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  46.28 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  46.61 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  46.03 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  47.29 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  46.92 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  47.06 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  46.83 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  47.96 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  47.75 
 
 		 446 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  46.03 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  47.49 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  47.52 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  45.88 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  44.85 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  46.38 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  45.64 
 
 		 448 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  43.15 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  43.15 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  41.55 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  47.96 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  42.92 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  45.43 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  45.43 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  44.72 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  44.27 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  43.81 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  43.58 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  44.72 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  42.05 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  37.22 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  39.37 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.66 
 
 		 521 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  33.78 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.75 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  22.75 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.75 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  27.69 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  28.77 
 
 		 442 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  24.67 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.74 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  32.45 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.97 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.57 
 
 		 571 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  26.16 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  28.57 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  27.46 
 
 		 510 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  32.16 
 
 		 522 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  32.16 
 
 		 522 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  32.16 
 
 		 522 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  29.48 
 
 		 528 aa  43.1  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>