139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1582 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  100 
 
 		 322 aa  651    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  52.17 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  51.86 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  47.38 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  47.38 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  49.2 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  45.68 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.53 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  34.29 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.08 
 
 		 431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.48 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30 
 
 		 404 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.6 
 
 		 414 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.92 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.65 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.09 
 
 		 437 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.17 
 
 		 442 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.16 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.31 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.24 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.77 
 
 		 642 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.52 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.62 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.47 
 
 		 822 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.04 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  27.08 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  27.27 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  32.08 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.08 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  32.14 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  31.07 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  31.25 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  32.99 
 
 		 477 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  31.96 
 
 		 487 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.94 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  23.5 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  29.9 
 
 		 485 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.79 
 
 		 162 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  30.93 
 
 		 494 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  30.21 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4794  hypothetical protein  28.12 
 
 		 518 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  hitchhiker  0.00337407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  36.63 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  29.17 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  31.96 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  37.62 
 
 		 167 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.11 
 
 		 166 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  28.12 
 
 		 524 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  30.39 
 
 		 462 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  30.39 
 
 		 462 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  30.39 
 
 		 475 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  26.79 
 
 		 439 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.63 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  28.33 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  30.93 
 
 		 502 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  28.12 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  29.13 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.11 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  25.27 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.76 
 
 		 171 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  33.64 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.64 
 
 		 187 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  33.87 
 
 		 188 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  28.12 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  28.12 
 
 		 504 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  40.32 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 		 192 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.87 
 
 		 188 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  37.1 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  33.87 
 
 		 188 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  33.87 
 
 		 188 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0510  hypothetical protein  30.93 
 
 		 450 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0494741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.63 
 
 		 244 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.58 
 
 		 171 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 625 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.63 
 
 		 244 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.62 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.26 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  33.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  33.87 
 
 		 171 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  36 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  33.87 
 
 		 186 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  34.58 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.7 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.65 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  36.46 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  36.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  36 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  32.95 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  33.87 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.89 
 
 		 160 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.6 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  34.94 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  34.94 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  34.94 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>