More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1547 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  100 
 
 
220 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  38.6 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.07 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  40.18 
 
 
231 aa  145  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 
229 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 
226 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  38.46 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  30.52 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  32.87 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  32.26 
 
 
236 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 
230 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  30.05 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  29.11 
 
 
226 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  30.88 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 
230 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  37.09 
 
 
223 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
517 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  31.6 
 
 
236 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  31.02 
 
 
220 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 
220 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 
220 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 
258 aa  99.4  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  31.25 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  30.52 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
502 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  29.6 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  29.6 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0280  Fis family transcriptional regulator  33.57 
 
 
450 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928901  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.03 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  31.36 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  26.01 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  26.64 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  27.85 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  29.77 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  36.53 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 
221 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  28.11 
 
 
221 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  28.11 
 
 
221 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  28.11 
 
 
221 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.85 
 
 
229 aa  91.7  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.75 
 
 
616 aa  91.7  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 
220 aa  91.7  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.98 
 
 
425 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
396 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  24.43 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.73 
 
 
223 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  25.93 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  37.88 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  32.16 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  31.16 
 
 
219 aa  89  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
636 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 
220 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.46 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.27 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  28.9 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.89 
 
 
230 aa  88.2  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.82 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  26.85 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 
227 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.93 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  23.53 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 
242 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  25.23 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  30.45 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  27.4 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.85 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.34 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  28.83 
 
 
228 aa  85.1  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  25.68 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  24.77 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.54 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.04 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  26.94 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.56 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  28.12 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  27.65 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  24.54 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  27.11 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>