More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1892 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 
381 aa  786  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  83.24 
 
 
371 aa  619  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  76.64 
 
 
354 aa  574  1e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  74.86 
 
 
358 aa  546  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  74.21 
 
 
356 aa  545  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.49 
 
 
356 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.62 
 
 
356 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.05 
 
 
356 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  68.86 
 
 
358 aa  522  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60 
 
 
356 aa  447  1e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.99 
 
 
371 aa  313  3e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.95 
 
 
346 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.1721e-08  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  47.62 
 
 
349 aa  308  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.58 
 
 
343 aa  307  2e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.1547e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  48.8 
 
 
371 aa  304  1e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.01 
 
 
360 aa  303  3e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.84 
 
 
347 aa  303  4e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.65 
 
 
351 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.98 
 
 
351 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  46.09 
 
 
342 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.98 
 
 
351 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.15048e-35 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.51 
 
 
360 aa  285  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 
364 aa  285  1e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.18 
 
 
367 aa  282  7e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  42.86 
 
 
399 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.27 
 
 
365 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.29 
 
 
386 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  43.15 
 
 
378 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.85 
 
 
364 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  41.13 
 
 
399 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  40.62 
 
 
398 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  43.61 
 
 
427 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  42.62 
 
 
403 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  43.23 
 
 
399 aa  274  2e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  42.6 
 
 
397 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  42.6 
 
 
364 aa  273  4e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  42.82 
 
 
396 aa  272  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  8e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.07 
 
 
340 aa  271  9e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  41.69 
 
 
357 aa  272  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  272  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  42.36 
 
 
374 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.45 
 
 
362 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.03 
 
 
362 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.5 
 
 
362 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  41.03 
 
 
391 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.86 
 
 
354 aa  269  6e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 
362 aa  268  9e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  41.04 
 
 
410 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.29 
 
 
341 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  42.49 
 
 
404 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  42.98 
 
 
428 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  40.68 
 
 
392 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  38.76 
 
 
350 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.48 
 
 
344 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.39 
 
 
359 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  40.42 
 
 
392 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.76 
 
 
343 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  40.42 
 
 
392 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1567  hypothetical protein  41.11 
 
 
346 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00430195  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.57 
 
 
348 aa  262  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  41.76 
 
 
413 aa  262  7e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  41.11 
 
 
411 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  38.61 
 
 
404 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  40.33 
 
 
425 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  42.61 
 
 
348 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  42.25 
 
 
399 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  43.19 
 
 
339 aa  260  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  39.53 
 
 
408 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  37.85 
 
 
346 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.27 
 
 
389 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  41.57 
 
 
342 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.91 
 
 
343 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.5 
 
 
358 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  39.89 
 
 
425 aa  259  5e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  39.39 
 
 
390 aa  259  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.88 
 
 
349 aa  258  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  41.76 
 
 
411 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  39.61 
 
 
425 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.17 
 
 
364 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  41.34 
 
 
406 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  38.81 
 
 
347 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  40.67 
 
 
375 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 
399 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  38.24 
 
 
349 aa  255  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  41.48 
 
 
411 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  40.46 
 
 
371 aa  254  1e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  39.42 
 
 
348 aa  254  1e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 
344 aa  254  1e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  41.16 
 
 
349 aa  254  2e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.17 
 
 
364 aa  254  2e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.17 
 
 
364 aa  254  2e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  41.28 
 
 
369 aa  254  2e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  38.46 
 
 
372 aa  254  2e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  40.23 
 
 
382 aa  254  2e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>