253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08926 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08926  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  35.53 
 
 
244 aa  164  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  35.53 
 
 
244 aa  164  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  33.9 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  37.99 
 
 
243 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  36.84 
 
 
229 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  34.09 
 
 
227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  41.67 
 
 
234 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  38.18 
 
 
246 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  38.18 
 
 
246 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  37.73 
 
 
246 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  35.78 
 
 
239 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  37.71 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  38.29 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  37.71 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  37.71 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.71 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  34.68 
 
 
229 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.71 
 
 
256 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  37.71 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.71 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  36.27 
 
 
243 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  31.72 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  30.65 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  33.04 
 
 
233 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0717  hypothetical protein  34.93 
 
 
236 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0448352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  37.7 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36.72 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  37.22 
 
 
218 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  33.94 
 
 
237 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  36.87 
 
 
239 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  36.15 
 
 
242 aa  134  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.7 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  35.71 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  36.11 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  38.37 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  36.67 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.77 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  34.7 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  34.25 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  33.03 
 
 
237 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  33.03 
 
 
237 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  33.03 
 
 
237 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  32.09 
 
 
238 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.03 
 
 
237 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  32.38 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  31.92 
 
 
253 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  33.65 
 
 
201 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  37.85 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37290  hypothetical protein  41.18 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000183786  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  33.03 
 
 
237 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3200  hypothetical protein  41.18 
 
 
237 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  39.8 
 
 
228 aa  131  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000163  allophanate hydrolase subunit 1  33.78 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.245335  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  34.72 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  33.03 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  31.9 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  35.56 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  31.94 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  35.56 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  35.56 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  30.88 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  36.71 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  34.47 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  30.53 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  46.28 
 
 
215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  33.03 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.58 
 
 
237 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  31.9 
 
 
228 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  31.9 
 
 
229 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  31.47 
 
 
243 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  44.8 
 
 
218 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  44.8 
 
 
218 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  45.6 
 
 
218 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  42.75 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  44.8 
 
 
218 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  44.8 
 
 
218 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  44.03 
 
 
226 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  32.86 
 
 
217 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  30.56 
 
 
221 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  33.53 
 
 
539 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  32.2 
 
 
218 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  31.08 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  45.53 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  40.15 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  37.76 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  32.58 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  32.09 
 
 
234 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  34.94 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  32.04 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  33.8 
 
 
215 aa  118  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  37.18 
 
 
541 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  45.53 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  45.53 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  45.53 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  45.53 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  45.53 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  45.53 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>