More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03065 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  100 
 
 
289 aa  584  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  69.55 
 
 
286 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  55.1 
 
 
293 aa  311  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  53.22 
 
 
295 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  53.56 
 
 
294 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  51.36 
 
 
297 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  56.67 
 
 
270 aa  291  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  48.63 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  47.46 
 
 
290 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.27 
 
 
287 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43 
 
 
287 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 
287 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.56 
 
 
295 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.03 
 
 
287 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
288 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.69 
 
 
287 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.69 
 
 
288 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.61 
 
 
309 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.84 
 
 
290 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 
288 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 
291 aa  224  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.88 
 
 
291 aa  224  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
282 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
290 aa  212  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 
290 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 
292 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 
290 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.74 
 
 
289 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
289 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  36.31 
 
 
345 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 
298 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38 
 
 
291 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.98 
 
 
290 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
296 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
288 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
288 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.75 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.63 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  38.11 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
283 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.59 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  37.21 
 
 
303 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  36.9 
 
 
287 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.05 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  37.76 
 
 
287 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.8 
 
 
290 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  36.68 
 
 
288 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 
290 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
296 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 
288 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.97 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.1 
 
 
285 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.91 
 
 
288 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.91 
 
 
288 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.55 
 
 
288 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.83 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  35.99 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.12 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.87 
 
 
294 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 
292 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.82 
 
 
296 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
292 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.03 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.02 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  37.92 
 
 
292 aa  188  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
286 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  33.45 
 
 
292 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.47 
 
 
291 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
293 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
293 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.17 
 
 
290 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
293 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.55 
 
 
292 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.05 
 
 
290 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.59 
 
 
286 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
290 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.59 
 
 
289 aa  185  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  38.06 
 
 
287 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.55 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  38.56 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  36.77 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  35.05 
 
 
308 aa  183  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  35.1 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.71 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>