More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02720 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  65.62 
 
 		 208 aa  281  8.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  73.27 
 
 		 147 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 103 aa  127  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 103 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 104 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  38.12 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.77 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37.13 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 103 aa  104  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 105 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  43.2 
 
 		 130 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 105 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 114 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 100 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.2  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  98.2  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  42.74 
 
 		 170 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  43.09 
 
 		 134 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 121 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  41.46 
 
 		 134 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 		 149 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  44.9 
 
 		 100 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  40.65 
 
 		 132 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  39.45 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 104 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.66 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  35.76 
 
 		 157 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92.8  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 102 aa  92.8  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.11 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  40.5 
 
 		 139 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  40.5 
 
 		 139 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  91.7  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 118 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  90.9  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 133 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  90.1  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  38.74 
 
 		 146 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  39.81 
 
 		 103 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.86 
 
 		 105 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  37.88 
 
 		 136 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>